工程结款的方式有以下几种：
分段结算
对于当年开工但当年不能竣工的项目，可以按照其工程形象进度划分不同阶段进行结算。分段结算可以按月预支工程款，当年结算的工程款应与年度完成的工作量一致，年终不另清算。
竣工后一次结算
规模较小的项目，可以实行工程价款每月预支，竣工后一次结算的方式。这种方式适用于工程承包合同价值在100万元以下，且建设期在12个月以内的项目。
按月结算
这是一种以分部分项工程为对象，实行旬末或月中预交、月终结算、竣工后清算的办法。跨年度竣工的工程，在年终进行工程盘点，办理年度结算。
目标结算方式
在工程合同中，将承包工程的内容分解成不同的控制界面，以建设单位验收控制界面作为支付工程价款的前提条件。完成并验收一个单元，就支付该单元的工程价款。
双方约定的其他结算方式
除了上述方式外，工程双方还可以根据具体情况约定其他结算方式。
工程结算流程
承包商提出付款申请
承包商根据完成的工程量和合同条款，向建设单位提出付款申请，并填报相关月报表。
工程师审核
工程师对承包商提交的付款申请进行全面审核，修正或删除不合理的部分，并计算付款净金额。若净金额小于合同规定的临时支付的最小限额，则工程师不需开具任何付款证书。
业主支付
业主收到工程师签发的付款证书后，按合同规定的时间支付给承包商。
注意事项
工程质量
工程结算的前提是工程质量经竣收后为合格，并符合建设合同的条件。
合同条款
工程结算方式、支付比例、结算时间等应在合同中明确约定，以避免后期纠纷。
进度款支付
在施工过程中，施工企业应按月（或形象进度、控制界面等）完成的工程数量计算各项费用，并向建设单位办理工程进度款的支付。
竣工结算
工程竣工后，承包人应提交竣工结算报告及完整的结算资料，发包人应在规定期限内进行核实并确认，然后支付工程竣工结算价款，并保留一定比例的质量保证金。
建议在选择工程结款方式时，综合考虑工程规模、工期、合同条款等因素，选择最适合的结算方式，并在合同中明确约定，以确保双方权益。
